| 部门 | 号码 | 地址 |
| 院长办公室 | 83795635 | 四牌楼校区科技逸夫科技馆南楼201室 |
| 党委书记办公室 | 83792748 | 四牌楼校区电子所楼北201室 |
| 副院长（研究生） | 83272496 | 丁家桥校区基一楼 |
| 副院长（本科） | 83792396-8002 | 四牌楼校区五五楼407室 |
| 副院长（科研） | 83795632-804 | 四牌楼校区科技逸夫科技馆南楼201室 |
| 党委副书记办公室 | 83794334 | 四牌楼校区电子所楼北203室 |
| 生物医学工程系 | 83793513 | 四牌楼校区新图书馆南楼四楼 |
| 信息与系统生物学系 | 83795174 | 四牌楼校区李文正楼北315室 |
| 医学与生物物理学系 | 83792620 | 四牌楼校区科技逸夫馆南楼402室 |
| 人事秘书、学院办公室 | 83792349 | 九龙湖校区生医楼509室 |
| 党委秘书 | 83792748 | 九龙湖校区生医楼510室 |
| 本科教学秘书办公室 | 83790730 | 九龙湖校区生医楼511室 |
| 研究生秘书、学科秘书办公室 | 83792749 | 九龙湖校区生医楼512室 |
| 设备管理、课外研学 | 83790735 | 九龙湖校区生医楼510室 |
| 外事秘书 | 83790820 | 四牌楼校区逸夫科技馆南楼207室 |
| 学生工作办公室（一） | 83793925 | 九龙湖校区生医楼501室 |
| 学生工作办公室（二） | 52090836 | 九龙湖校区梅园4舍生音阁 |
| 通信地址： | 南京玄武区四牌楼2号 |
| | 东南大学生物科学与医学工程学院 |
| 邮政编码： | 210096 |
| 办公地点： | 四牌楼校区电子所楼北楼 |
