白云飞

发布者:李冬梅发布时间:2013-03-01浏览次数:20218

 白云飞,男,197512月,湖北武穴人。生物医学工程博士,副教授,博士生导师。信息与系统生物学系副主任。江苏省生物信息学会专委会委员,中国生物医学工程学会会员,中国生物医学工程学会人工智能分会会员。主持国家自然基金4项、国家973项目子课题1项,参加重大研发项目2项及国家自然基金4项。发表SCI论文10篇,合作发表SCI论文20余篇。Analytical Biochemistry OncotargetAnalytical LettersBMC Cancer等国际杂志审稿人。


教育及工作背景:

    2015/02–2016/12,美国哈佛大学医学院及布莱根妇女医院神经基因组学中心,Research Scholar,合作导师:Prof. Clemens R. Scherzer

    20054-20074月 东南大学 生物医学工程 讲师

    20074-至今 东南大学 生物医学工程 副教授、博士生导师

    2001/09–2005/04,东南大学,生物医学工程系,博士,导师:陆祖宏 教授

    1998/09–2001/06,南京农业大学 水产生物技术 硕士 导师:李婷婷教授、夏德全院士

    1994/09–1998/06,南京农业大学 淡水渔业 学士


研究方向

    1)生物信息技术;

    2)基于高通量DNA测序技术的开发及应用

    3MicroRNA的表达分析

    4)全转录组分析与应用;

    5circRNA检测及功能分析


发表或合作发表的论文:

1. Xianjun Dong, Zhixiang Liao, David Gritsch, Yavor Hadzhiev, Yunfei Bai, Boris Guennewig, Ganqiang Liu, Cornelis Blauwendraat, Tao Wang, Charles H Adler, Matthew P Frosch, Peter T Nelson, Joseph J Locascio, Patrizia Rizzu, Antony A Cooper, Peter Heutink, Thomas G Beach, John S Mattick, Ferenc Müller, and Clemens R Scherzer. Enhancers active in dopamine neurons are a primary link between genetic variation and neuropsychiatric disease. Nature Neuroscience201821, 14821492 . (IF= 19.912)

2.Zhang W, Fan G, Yi H, Jia G, Li Z, Yuan C, Bai Y, Fu D,. Interfacial Engineering of Hierarchical Transition Metal Oxide Heterostructures for Highly Sensitive Sensing of Hydrogen Peroxide. Small. 2018 May;14(19):e1703713. (IF= 8.643)

3.Qian Z, Liu H, Li M, Shi J, Li N, Zhang Y, Zhang X, Lv J, Xie X, Bai Y, Ge Q, Ko EA, Tang H, Wang T, Wang X, Wang Z, Zhou T, Gu W. Potential Diagnostic Power of Blood Circular RNA Expression in Active Pulmonary Tuberculosis. EBioMedicine. 2018 Jan;27:18-26. (IF=5.420)

4.Zhang Z, Kong Z, Zhu M, Lu W, Ni L, Bai Y, Lou Y. Whole genome sequencing identifies ANXA3 and MTHFR mutations in a large family with an unknown equinus deformity associated genetic disorder. Mol Biol Rep. 2016 Oct;43(10):1147-55.

5.Bai Y, Xue Y, Xie X, Yu T, Zhu Y, Ge Q, Lu Z. The RNA expression signature of the HepG2 cell line as determined by the integrated analysis of miRNA and mRNA expression profiles. Gene. 2014 Sep 10; 548(1):91-100.

6.Yunfei Bai, Dai Lin, Qin Han, Yaojuan Jia, Jing Tu, Junfeng Luo, Qinyu Ge, Dingdong Zhang, and Zuhong LuDiscrimination of Single Nucleotide Mutation by Using a New Class of Immobilized Shared-Stem Double-Stranded DNA Probes. J. Biomed. Nanotechnol. 7, 640-647 (2011) (IF= 4.521)

7.Yunfei Bai, Dai Lin, Qin Han, Wanjun Gu, Qinyu Ge and Zuhong Lu. Genome-wide Survey of MicroRNA–transcription Factor Rel/NF-кB Feed-forward Regulatory Circuits in Human. Advanced Science Letters. 5(2), 492-495(4)(2012

8. Yunfei Bai, Qin Han, Dai Lin, Junfeng Luo, Jin Tu, Qinyu Ge and Zuhong Lu. Structure-function relationships of three kinds of immobilized DNA probes in the discrimination abilities of single nucleotide variation. Journal of Nanoscience and Nanotechnolgy 2012 Mar;12(3):1748-53.

9. Yunfei Bai, Qinyu Ge, Jinke Wang, Tongxiang Li, Quanjun Liu, Zuhong Lu, “Optimization of on-chip elongation for fabricating double-stranded DNA microarrays”, Colloids and SurfacesB: Biointerfaces, 40(2005)153-158 IF=3.887

10.Yunfei Bai, Qinyu Ge, Jinke Wang, Tongxiang Li, Quanjun Liu, Zuhong Lu, “Investigation of DNA-protein sequence-specific interactions with a ds-DNAarray”,Molecules, 10(2005)417-426

11. Yunfei Bai, Qinyu Ge, Tongxiang LiJinke Wang, , Quanjun Liu, Zuhong Lu“Endonuclease-based method for detecting the sequence specific DNA binding protein on double-stranded DNA microarray”, Chinese Chemical Letters, 16(5)(2005)651-654

12.Yunfei Bai, Qinyu Ge, Quanjun Liu, Tongxiang Li, Jinke Wang, Zuhong Lu, “A free labeled method for DNA-binding protein detection using a double stranded DNA microarray”,Journal of Nanoscience and Nanotechnology, 5(2005)1216-1219.

13. Yunfei Bai, Qinyu Ge, Quanjun Liu, Tongxiang Li, Jinke Wang, Zuhong Lu. Evaluating the Binding Affinities of NF-kB p50 Homodimer to the Wild-type and Single-nucleotide Mispair DNA Binding Sites by the Unimolecular Double-stranded DNA. Journal of Nanoscience and Nanotechnology. 6, 1014–1018 (2006).


获奖情况:

    1. 江苏省科技奖,项目名称:三位DNA芯片的制备及其在核酸检测中的应用研究,三等奖,2010年,证书号:2010-3-15-R5,第五完成人。

    2. 江苏省科技奖,项目名称:转录因子kB分子检测技术研发及其临床应用,三等奖,2011年,证书号:2011-3-110-R5,第五完成人。

    3. 浙江省医药卫生科技奖,项目名称:噪声性耳聋的流行病学及易感基因研究,二等奖,2012年,证书号:12049,第二完成人。

    4. 教育部自然科学奖,项目名称:DNA微阵列芯片,二等奖,2014年,证书号:2013-066,第三完成人。


主持或参入的科研项目:

 1. 国家自然科学基金面上项目,61871121,基于三代高通量测序的环状RNA可翻译性研究,2018/01-2022/12, 63万元,在研,主持。

 2. 国家重点研发计划2018YFC1314900糖尿病信息化管理平台与传播体系创建及示范应用,981万元 2018.8-2020.12。 参入

 3. 国家自然科学基金面上项目, 61271054,一种新的基于CpG岛靶标富集的全基因组甲基化分析方法及其在与肿瘤miRNA/mRNA表达谱关联分析中的应用研究,2013/01-2016/12, 76万元,已结题,主持。

 4. 国家自然科学基金面上项目,60971021,新一代高通量DNA测序技术在肿瘤miRNA/mRNA差异表达分析中的应用方法研究,2010/01-2012/12,33万元,已结题,主持。

    5.   973三级子课题,2006CB705602-9,纳米颗粒对不同细胞系中多种转录因子的表达影响的定量分析,2006/10-2011/10, 10万元,已结题,主持。

    6.   863重点项目,2006AA020702,快速低成本人类基因组测序技术和装备,2006/01-2010/12480万元,已结题,参与。

    7.  国家973项目二级课题,2006CB705602,纳米颗粒产生的特殊毒理学效应及其靶器官选择性,2006/10-2011/10180万元,已结题,参与。

 8. 国家自然科学基金青年基金,60501010,基于双链DNA 电化学芯片的DNA 结合蛋非标记检测方法的应用研究,2006/01-2008/12,24万元,已结题,主持。


联系方式:

E-mailwhitecf@seu.edu.cn; Cell-phone:13912947965