本实验室主要从事新一代DNA测序技术平台的开发和应用的研究工作,研究内容包括新一代DNA测序技术的文库制备流程的优化与开发,测序方案的设计与实施,基于新的测序方案的生化流程的建立,以及测序数据处理算法设计和高级生物信息的处理等。
本实验室通过对新一代DNA测序的全系统解决方案的研究,力图建立全自动化的文库制备装置,降低人为因素对文库制备稳定性的影响,并减少实验过程对人力资源的需求;开发了两套分别基于编码和解码的高通量DNA测序方案,在不增加测序反应数的基础上,提升测序读长、测序准确度等性能指标;建立适用于自主平台的图像处理、碱基识别和高级生物分析软件;基于高通量测序平台,针对目前生物学和医学的研究热点,如非编码RNA、环境微生物、核酸单体型等,建立针对性的文库制备和生物信息处理方案,拓展应用领域,提升应用效率。
平台主任(负责人):陆祖宏
中心(实验室)组成员:陆祖宏、肖鹏峰、刘全俊、吕华、白云飞、李敏俐、涂景
联系电话:83793310
基因测序实验室主要仪器设备 |
序号 | 设备名称 | 型号 | 用途 | 安放地点 | 仪器管理人 |
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1 | 基因测序仪 | ion torrent PGM | 基因测序 | 逸夫科技馆 | 刘全俊 |
2 | 基因测序仪 | ion torrent Proton | 基因测序 | 逸夫科技馆 | 刘全俊 |
3 | 基因测序仪 | ion torrent Proton | 基因测序 | 逸夫科技馆 | 刘全俊 |
4 | 倒置式生物显微镜 | 尼康TE2000-PES | 显微成像 | 五五楼401-1 | 吕华 |
5 | 超声波破碎仪 | Covaris S2 | 核酸打断,细胞破碎 | 五五楼408 | 白云飞 |
6 | 荧光定量PCR仪 | Chromo4 | 核酸定量分析 | 五五楼408 | 涂景 |
7 | 曙光服务器 | I840 | 集群运算 | 五五楼409-1 | 涂景 |
8 | 微量分光光度计 | Nanodrop ND-1000 | 微量核酸定量 | 五五楼406 | 白云飞 |